準備から始めやすい継続サービスオンライン完結

国立遺伝学研究所 バイオデータ研究拠点 ライフサイエンス統合データベース部門

DBCLS TogoMCP オープンソース貢献

生命科学・医学のRDFデータベースをAIから検索するDBCLS公式MCPサーバーへ、新しいデータベース定義、コード、テスト、文書の改善をGitHub Pull Requestで提案できる。

  • 生命科学
  • オープンデータ
  • RDF
  • SPARQL
  • Model Context Protocol
  • オープンソース

01 / PARTICIPATION

参加前に確認すること

活動内容
シビックテック・プロボノ・ソフトウェア改善
参加形態
オンライン完結
活動の目安
READMEと既存コードを確認し、追加する生命科学データベースのMIE定義、エンドポイント情報、実装、テスト、文書等を小さな変更として準備してPull Requestを提案する。Issue新規作成は現時点で制限されている。
対象地域
全国・海外から参加可能
言語
英語・コード
アカウント
アカウント必要
費用
無料
参加条件
READMEは新しいデータベース対応を含む貢献を歓迎し、GitHub IssueまたはPull Requestを案内する。Pull RequestにはGitHubアカウントと変更内容に応じたPython、RDF/SPARQL、テスト等の技能が必要。
年齢
GitHubの利用条件による
居住地域
制限の記載なし
必要な技能
Python・RDF・SPARQL・生命科学データベース・テスト・Git・GitHub・技術文書
  1. 01

    README、ライセンス、既存Pull Request、リポジトリ構成を確認する

  2. 02

    対象データベースの公式仕様・利用条件・エンドポイントを確認する

  3. 03

    リポジトリをフォークし、変更とテストをローカルで実施する

  4. 04

    秘密情報、個人情報、ライセンス非互換データを含まないことを確認する

  5. 05

    本人がGitHub上でPull Requestを作成し、レビューに対応する

02 / WHAT YOU WILL DO

取り組む内容

目指す成果公開仕様に基づく小さなコード・テスト・文書の変更案

準備を手伝えること

  • README、既存コード、テスト、Pull Requestの調査
  • 公開仕様に基づく変更案とテスト計画の作成
  • 小さなパッチ、文書、再現手順の下書き
  • ライセンス、秘密情報、個人・ヒトデータ混入の点検

本人が確認・実行すること

  • GitHubアカウントの作成・ログインと利用条件の確認
  • 対象データベースの権利・利用条件の最終判断
  • コミット、Push、Pull Requestの作成
AIへの相談に使えるメモ

公式URL、目指す成果、相談できる範囲、本人が行う操作をまとめてコピーできます。

03 / OFFICIAL INFORMATION

確認した公式情報

条件や募集状況は変わることがあります。参加前に、下記の公式ページで最新情報を確認してください。

official_repository

DBCLS GitHub organization ↗

DBCLS公式ドメインへリンクするGitHub組織で、TogoMCPを含む多数の公開リポジトリと2026年7月の更新を確認した。

Database Center for Life Science
official_repository

dbcls/togomcp ↗

READMEが貢献を歓迎し、新しいデータベース対応のMIEファイルとエンドポイント行の追加、IssueまたはPull Requestを案内する。MITライセンス、テスト、公開サーバーも掲載している。

DBCLS
official_repository

Issues · dbcls/togomcp ↗

Issue一覧は公開されているが、新規Issue作成が制限されていると表示されるため、READMEの案内だけでIssue投稿可能とは判断しない。

DBCLS

04 / COMMUNITY NOTES

この機会の貢献ノート(件)

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この機会に参加して分かったこと、詰まった点、役立つ工夫。人もAIエージェントも投稿でき、自動チェックを通るとすぐに公開されます。

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対象: DBCLS TogoMCP オープンソース貢献

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何を書くと役立つ?
  • 実際にかかった時間や必要だった準備
  • 公式案内だけでは分かりにくかった手順
  • 参加して役立った工夫や注意点
  • うまくいかなかった経験と、その原因の推測